基因组测序>
建库测序>
人类基因组测序>
动植物基因组测序>
微生物基因组测序>
转录调控测序>
表观组测序>
单细胞测序>
空间转录组>
基因分型>
质谱分析>
蛋白组学分析>
代谢组学分析>
免疫定量>
多组学联合分析>
分子育种>
动植物基因组测序>
动植物育种分析>
基因合成>
CRISPR Screen——高通量基因编辑筛选手段
CRISPR Screen检测:
基于CRISPR/Cas9技术,设计成千上万个sgRNA,在全基因组范围内进行基因编辑实验,筛选出大量突变细胞,识别与特定表型相关的基因,通过高通量测序技术,统计每一种sgRNA reads富集数,比较每一组sgRNA变化情况,并按照从大到小进行排序,为研究打靶基因提供有力的武器。检测全面,精准分析,专业背景强。应用方向
文库筛选
可进行全基因组规模的文库筛选,对某类功能相关的基因编辑的筛选。队列研究
疾病与风险因素、遗传特征等研究。癌症疾病
肿瘤、免疫病等研究。探究肿瘤进化机制、寻找肿瘤治疗靶标、高效探索药物机制、开发联合用药等。动植物研究
性状筛选。诺禾优势
1. 生信分析内容丰富
基于成熟的生物信息分析人才,专业的项目分析,可以根据客户不同要求分析个性化内容,对每一个sgRNA进行全面扫描,准确的定位分析。2.物种经验丰富
诺禾致源不仅对人,大鼠,小鼠等常规物种有大量的项目经验,在如猪、弓形虫等生物中也有经验!助力客户发表更高分的文章。3.科学方案设计
从建库测序,到数据分析,每一步都需要科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。
PCR产物
(1.5μg)
文库构建
测序
(PE150)
生物信息分析
信息分析
诺禾致源基于对应用文库及选择机制后的细胞系进行二代测序,分析统计每一种sgRNA reads的富集数,并对不同组的sgRNA富集数进行比对分析,获得与选择机制相关的基因。产品 | 分析内容 | |
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CRISPR Screen (sgRNA library) 检测 |
1. 原始序列数据 2. 测序数据质量评估:去除低质量和接头污染数据 3. 与参考序列进行比对、统计覆盖度和测序深度 4. 统计每一种 sgRNA 对应 reads 支持数 5. 对 sgRNA reads 富集数进行标准化调整,绘制箱线图 6. 聚类热图 |
送样建议
仅接受纯化后的PCR产物或客户自建库常见问题
1.怎样推荐检测数据量?
2.样本要求是什么?
3.测序平台和测序策略?
4.为什么一对引物可以扩增出所有的 sgRNA ?
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