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NGP-C-11K种牛优良个体鉴定芯片

NGP-C-11K种牛优良个体鉴定芯片

  • 20世纪末,世界范围内平衡育种理念在牛育种中逐渐形成,牛肉是优质的蛋白质来源。数据显示,2018年以来,我国人均牛肉需求量年增长都在10%左右。说到牛肉,很多人会感觉外国的牛肉品质更好。其实,我国本土牛的种质资源丰富,但是相关的育种等工作起步较晚,优质国产肉牛品种不多,国产肉牛的市场效益也不好。因此, 近年来,国内的科研人员正积极从国产牛的种质资源中寻找素材,培育属于咱自己的高端肉牛品种
    诺禾致源搜集了400余份包括54个品种牛的重测序数据,初筛得到了60439391个高质量SNP,芯片基于54个牛的地理分布,分群信息以及多态性等遗传信息最终获得了11010个高质量位点,最终形成了NGP-C-11K种牛优良个体筛选芯片。

品种覆盖率极高

位点来源

产品参数

  • NGP-C-11K的核心SNP位点在基因组上均匀分布,次等位基因频率在0.3-0.5之间,90%的位点处于基因区域。
  • NGP-C-11K芯片可完成荷斯坦牛、安格斯牛等20余个优良品种、野生品种的精准品种鉴定工作。
  • 品种鉴定是种质资源保护和新品种认证的关键一步。传统的品种鉴定主要依据表型信息进行区分,存在发育早前难以区分或鉴定准确度较低的问题。采用NGP-C-11K芯片位点作为鉴定依据同时使用先进的机器学习分类模型可以准确划分相似品种,鉴定待测样本所属品种类别。
#Sample judge_result judge_ratio KNN NB RF SVM C5.0 PLS
M_1 group3 0.6923 group3 group1 group1 group3 group3 group3
M_10 group3 0.8462 group3 group1 group3 group3 group3 group3
M_11 group2 0.6923 group2 group3 group2 group2 group3 NA
M_12 group3 0.8462 group3 group1 group3 group3 group3 group3
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产品优势

  • 1.基于基因组学多维度设计芯片位点,位点检出率,变异一致率高达99%

  • 2.周期短,诺禾可实现千个样本两周内完成检测,单个样本不足百元

  • 3.高精度,可实现54个牛品种的高精度品种鉴定分析

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