基因组测序>
建库测序>
人类基因组测序>
动植物基因组测序>
微生物基因组测序>
转录调控测序>
表观组测序>
单细胞测序>
空间转录组>
基因分型>
质谱分析>
蛋白组学分析>
代谢组学分析>
免疫定量>
多组学联合分析>
分子育种>
动植物基因组测序>
16S、18S、ITS等扩增子测序(二代) 一步到位检测环境微生物多样性
扩增子测序是对特定长度的PCR产物或捕获的片段进行测序,分析序列中的变异。应用方向
医学领域:疾病与人体微生物间关系,如代谢类疾病、消化类疾病、自身免疫性疾病、肿瘤癌症、神经类疾病及其他疾病等诺禾优势
1.读长长, 周期短, 性价比高
采用 NovaSeq 6000 测序平台。NovaSeq 6000 测序平台通量更高,速度更快,运行时间更短,周期最短可达10天2.科学方案设计
从材料选取,建库测序,到数据分析, 每一步都需要科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果60人
分析团队9年
项目经验100000+
结题项目1对1
项目服务信息分析
基于目标区域的测序,检测序列丰度,以充分研究环境微生物多样性和群落结构差异性。除QIIME1流程外,诺禾还实现全流程QIIME2分析,QIIME2中的插件DADA2可以修正测序错误,注释更为精准,且提供了多种可交 互式图形系统展示,详细介绍见“QIIME2为你而来”标准分析 | 解决问题 |
---|---|
物种注释 | 物种注释及各物种丰度信息 |
α-多样性分析 | 微生物群落的丰富度和多样性 |
β-多样性分析 | 不同样本间的微生物群落 及各样本差异情况 |
多元统计分析 | 寻找组间具有显著差异的物种, 同时可以比较组内差异和组间差异 的大小,判断分组是否有意义 |
CCA分析 | 研究物种组成与环境因子间的关系 |
环境因子关联分析 | |
VPA分析 | |
功能预测 | 预测样本的功能组成 |
高级分析 | 解决问题 |
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肠型分析 | 肠道菌准确定位和疾病预测和治疗 |
贝叶斯网络图 | 判断微生物之间、微生物和环境、 代谢物间的依赖关系 |
Source Tracker | 样本中微生物群落来源 |
送样建议
样本类型 | 建议送样量 | 最低送样量 |
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土壤/污泥/沉积物/腐殖质 | 3g | 0.5g |
水体滤膜(孔径 0.22-0.45μm/直径 3-4cm) | 2张 | 1张 |
拭子 | 3个 | 1个 |
瘤胃液/发酵液/组织液(离心有明显沉淀) | 3mL,沉淀1g | 1mL,沉淀0.5g |
粪便/肠道内容物 | 2g(小鼠 6 粒) | 0.5g(小鼠 3 粒) |
动物/人组织 | 1g | 0.5g |
血浆 | 3mL | 1mL |
鲜奶 | 20mL | 8mL |
常见问题
1.16S测序哪个区域比较合适?
2.若关注环境中的真核微生物多样性,ITS测序和18S测序哪个更好?
3.扩增子与宏基因组的区别?
4.样本送到公司,什么时候可以拿到结果?
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