基因组测序>
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动植物基因组测序>
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转录调控测序>
表观组测序>
单细胞测序>
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动植物基因组测序>
全长转录组-三代测序助力转录组数据解读
全长转录组是基于Pacbio平台或Nanopore平台进行测序获得物种转录组信息的方法,其可以获得mRNA全长序列,克服转录本拼接短、信息不完整的难题,实现可变剪切及融合基因等结构变异的研究。应用方向
农学
完善基因组/转录组信息:复杂基因结构,转录本结构和功能分析。医学
融合现象解析:融合基因的癌症致病机理。诺禾优势
平台优,质量好,性价比高
基于强大的Pacbio平台或Nanopore平台,获取mRNA全长序列,文库构建时无需将转录本打断,信息分析无需组装,准确重构转录组全貌。55天
项目周期测序平台
PacBio or NanoporeAll
信息分析信息分析
诺禾致源全长转录组测序项目信息分析,经过严格数据质控保证数据分析可靠性,准确获取转录本信息。有参全长转录组分析条目 | 无参全长转录组分析条目 |
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数据质控,转录本鉴定、聚类与校正 | 数据质控,转录本鉴定、聚类与校正 |
与参考基因组比对 | SSR分析 |
可变剪切分析 | 蛋白编码框(CDS)预测 |
新基因、新转录本预测 | 转录本的GO/KOG/KEGG分类 |
七大数据库功能注释 | 七大数据库功能注释 |
融合基因分析 | LncRNA编码潜能预测 |
lncRNA 编码潜能预测 | 样本间转录本比较 |
可变腺苷酸化分析 | 动植物转录因子分析 |
样本间转录本比较 | 基因表达水平分析(相关性,差异表达分析) |
动植物转录因子分析 | 差异表达基因GO和KEGG 富集分析 |
基因表达水平分析(相关性,差异表达分析) | |
差异表达基因GO和KEGG 富集分析 |
送样建议
样本类型 | 送样建议-PacBio | 送样建议-Nanopore |
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新鲜动物组织干重 | ≥ 0.8g | ≥0.3g |
新鲜植物组织干重 | ≥ 1g | ≥0.5g |
新鲜培养细胞数量 | ≥ 5×10 7个 | ≥ 5×10 6个 |
全血(加入Trizol) | ≥ 10mL | ≥ 5mL |
菌体 | ≥ 5×10 7个/≥ 0.8g | ≥ 5×10 6个/≥ 0.3g |
常见问题
1.全长转录组是否需要打断,拼接?
2.全长转录组检测准确率如何?
3.PB全长转录组为什么推荐“三+二”?
4.全长转录组是否获得全部LncRNA
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