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基因组测序

二代建库测序/纯测序服务

二代建库测序/纯测序—短周期、高质量

建库测序产品是以自动化建库平台、自动化质控流程和高性能的计算平台为技术依托,对合作伙伴提供的合格样品进行建库并运用二代测序平台测序,或者对合作伙伴提供的合格文库直接进行测序,产出高质量的测序数据提供给客户进行生物信息学分析。

诺禾优势

  • 1. 多元化精准的产品类型

    DNA文库 RNA文库 PCR-free文库 自建库
    非常规小片段文库
    宏基因组文库
    人外显子文库
    人重测序文库
    全基因组DNA甲基化文库
    ChIP-seq文库
    RAD文库
    普通转录组文库
    链特异性转录组文库
    原核链特异性文库
    宏转录组文库
    lncRNA文库
    sRNA文库
    circRNA
    扩增子文库
    PCR产物文库
    基因组PCR-free文库
    自建库散样
    自建库包lane
    自建库包flow cell
  • 2.全方位详尽的测序策略

    测序平台 测序策略及形式 数据产出
    Novaseq 6000 PE150纯测序散样/包lane/包FC 800G/lane
    3.2T/flowcell
    PE250纯测序散样/包lane/包FC 400M/lane
    800M/flowcell
    SE50纯测序散样/包lane/包FC 400M/lane
    800M/flowcell
    PE50纯测序包FC 800M/flowcell
    Novaseq X Plus PE150纯测序散样/包lane/包FC 1000G/lane
    3.2T/flowcell
    DNBSEQ-T7 PE150纯测序散样/包lane/包FC 1.5T/lane
    800M/flowcell
  • 3.高质量的数据产出

    诺禾致源建库测序平台获得 illumina 颁发的 CSPro 资质证书,并成为 illumina 在中国大陆的 IGN 人重测序服务商。我们承诺的测序数据指标均高于 illumina 官方标准,可在测序服务合同中体现。
    测序策略 数据量交付标准 数据质量交付标准
    SE50 ≥平均测序数据量的98% 平均Q20≥90%,平均Q30≥85%
    PE150 ≥平均测序数据量的98% 平均Q20≥90%,平均Q30≥85%
    PE250 ≥平均测序数据量的98% 平均Q20≥90%,平均Q30≥85%
  • 4.极速的项目周期

    诺禾致源依托柔性智能交付平台 Falcon ,满足四大产品类型(WGS、WES、RNAseq、建库测序产品)共线并行的交付,极大的提高了产品交付周期和数据质量。

常见问题

  • 1. 二代测序错误率为什么开始和末期会升高?

    • (1)测序错误率用E表示,碱基质量值用Q表示,Qphred=-10log10(e)Q30/Q20对应碱基正确率99.9%和99%。
      (2)一般测序片段前段几个bp以及片段末端的错误率会偏高;测序错误率会随片段长度增加而升高,这是由于化学试剂消耗造成的,是Illumina平台的共有特征。(非常规片段文库测序质量Q20、Q30会降低一些)。
  • 2. 文库产出均一性指什么

    • 测序时,同一条lane中的文库,产出数据量与文库加入量保持均一。例如混5个库,共得到50G数据,不会出现某一文库数据量30G而另一文库数据量只有5G的现象,要均等的每个库为10G。
  • 3. 基因组污染对RNA测序的影响?

    • 基因组污染会影响RNA的准确定量,会对后期建库及库容的计算造成影响;其次如果磁珠富集过后的RNA还存在基因组污染,会在后续的RNA建库过程中引入基因组的数据,对后续的分析产生影响。 可通过DNA酶消化去除,或PCR后切胶。
  • 4. 文库库检出现接头污染/含小片段如何处理?

    • 对于接头污染或引物二聚体污染可用磁珠纯化加以处理,而小片段文库只能切胶纯化,纯化效率一般在30%左右,风险比较高。

拓展材料

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