基因组测序>
建库测序>
人类基因组测序>
动植物基因组测序>
微生物基因组测序>
转录调控测序>
表观组测序>
单细胞测序>
空间转录组>
基因分型>
质谱分析>
蛋白组学分析>
代谢组学分析>
免疫定量>
转化医学>
转化医学及临床试验服务>
伴随诊断一站式解决方案>
多组学联合分析>
二代建库测序—短周期、高质量
建库测序产品是以自动化建库平台、自动化质控流程和高性能的计算平台为技术依托,对合作伙伴提供的合格样品进行建库并运用 illumina 测序平台测序,或者对合作伙伴提供的合格文库直接进行测序,产出高质量的测序数据提供给客户进行生物信息学分析。诺禾优势
1. 多元化精准的产品类型
DNA文库 | RNA文库 | PCR-free文库 | 自建库 |
---|---|---|---|
非常规小片段文库 宏基因组文库 人外显子文库 人重测序文库 全基因组DNA甲基化文库 ChIP-seq文库 RAD文库 |
普通转录组文库 链特异性转录组文库 原核链特异性文库 宏转录组文库 lncRNA文库 sRNA文库 circRNA |
扩增子文库 PCR产物文库 基因组PCR-free文库 |
自建库散样 自建库包lane 自建库包flow cell |
2.全方位详尽的测序策略
测序平台 | 自建库产品类型 | 数据产出 |
---|---|---|
Novaseq 6000 | Novaseq PE150 自建库散样/lane/FC | 800G/lane 3.2T/flowcell |
Novaseq PE250 自建库散样/lane/FC | 400M/lane 800M/flowcell | |
Novaseq PE50 自建库散样/lane/FC | 400M/lane 800M/flowcell | |
Novaseq SE50 自建库散样/lane/FC | 400M/lane 800M/flowcell |
3.完善的服务团队
至2021年为止,建库测序服务团队拥有9年项目经验,结题数目超过50000个,具有完善的服务体系和技术团队。50人
分析团队9年
项目经验50000+
结题项目1对1
项目服务4.高质量的数据产出
诺禾致源建库测序平台获得 illumina 颁发的 CSPro 资质证书,并成为 illumina 在中国大陆的 IGN 人重测序服务商。我们承诺的测序数据指标均高于 illumina 官方标准,可在测序服务合同中体现。测序策略 | 数据量交付标准 | 数据质量交付标准 |
---|---|---|
SE50 | ≥目标数据量的90% | 平均Q20≥95%,平均Q30≥90% |
PE150 | ≥目标数据量的90% | 平均Q20≥85%,平均Q30≥80% |
PE250 | ≥目标数据量的90% | 平均Q20≥85%,平均Q30≥80% |
5.极速的项目周期
诺禾致源依托柔性智能交付平台 Falcon ,满足四大产品类型(WGS、WES、RNAseq、建库测序产品)共线并行的交付,极大的提高了产品交付周期和数据质量。送样建议
文库类型 | 二代DNA文库类型 | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DNA小片段文库 | 人外显子、目标区域捕获 | PCR-free | RAD-Seq | GBS-Seq | 甲基化 | RRBS | 扩增子 | 宏基因组 | |
植物组织 | ≥0.5g | - | ≥3g | ≥1g | ≥0.5g | ≥2g | ≥2g | ≥0.5g | - |
动物组织 | ≥0.3g | ≥0.5g | ≥1.5g | ≥0.5g | ≥0.5g | ≥1g | ≥1g | ≥0.3g | - |
细胞 | ≥5×10 6个 | ≥5×10 7个 | ≥5×10 8个 | ≥5×10 7个 | ≥5×10 7个 | ≥5×10 8个 | ≥5×10 8个 | - | - |
动物血液(哺乳类) | ≥1mL | ≥1mL | ≥5mL | ≥1mL | ≥1mL | ≥2mL | ≥3mL | ≥1mL | - |
动物血液(红细胞有核类) | ≥0.5mL | ≥0.5mL | ≥3mL | ≥0.5mL | ≥0.5mL | ≥1mL | ≥2mL | ≥0.5mL | - |
唾液 | ≥4mL | ≥4mL | ≥10mL | - | - | - | ≥10mL | ≥4mL | - |
菌液(对数生长期) | >4mL | - | ≥0.5g | - | - | - | - | ≥0.5g | - |
菌体 | 对应菌液离心,可见明显沉淀 | - | ≥5mL 菌液离心 | - | - | - | - | ≥4mL 菌液离心 | - |
土壤 | - | - | ≥3mL (离心管刻度) | - | - | - | - | ≥2mL (离心管刻度) | ≥5mL (离心管刻度) |
粪便、肠道内容物、食糜 | ≥1mL(离心管刻度) | - | ≥2mL (离心管刻度) |
- | - | - | - | ≥1mL (离心管刻度) |
粪便、肠道内容物≥2mL; 食糜≥4mL(离心管刻度) |
瘤胃液 | ≥2mL | - | ≥2mL | - | - | - | - | ≥2mL | ≥2mL |
水体(滤膜) | 直径4cm,滤膜3张 | - | 直径4cm,滤膜3张 | - | - | - | - | 直径4cm,滤膜3张 | 直径4cm,滤膜3张 |
FFPE | 厚度在5-10μm,含组织面积大于25mm2的切片6张 | - | - | - | - | - | - | - | - |
拭子 | ≥4个 | ≥4个 | ≥10个 | - | - | - | - | ≥4个 | ≥5-10个 |
毛发 | ≥20根 | ≥20根 | - | - | - | - | - | - | - |
样本类型 | 二代RNA文库类型 | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
普通转录组/DGE | LncRNA | 宏转录组文库 | 原核链特文库 | smallRNA | circRNA | 备注 | |||
新鲜植物组织干重 | ≥0.3g | ≥0.3g | ≥0.3g | ≥0.8g | - | - | ≥0.8g | ≥1g | 成熟部位例如植物茎、根、种子等建议2倍以上送样 |
新鲜动物组织干重 | ≥0.2g | ≥0.2g | ≥0.2g | ≥0.5g | - | - | ≥0.5g | ≥0.8g | 核酸不丰富部位例如脂肪、成熟皮肤、骨头等建议酌情增加送样量 |
新鲜培养细胞 | ≥2×10 6个 | ≥2×10 6个 | ≥2×10 6个 | ≥10 7个 | - | - | ≥10 7个 | ≥5×10 7个 | - |
新采集的全血(加入Trizol) | ≥5ml(全血:Trizol=1:3) | ≥5ml(全血:Trizol=1:3) | ≥5ml(全血:Trizol=1:3) | ≥8mL | - | - | ≥8mL | ≥10mL | - |
PAXgene采血管 | ≥2管 | ≥2管 | ≥2管 | ≥3管 | - | - | ≥3mL | ≥5mL | - |
血清/血浆/细胞上清液/胸腔积液/脑脊液 | - | - | - | ≥20mL | ≥20mL | ≥20mL | ≥20mL | - | - |
唾液 | - | - | - | ≥5mL | ≥5mL | ≥5mL | ≥5mL | - | - |
石蜡切片 | 厚度在5-10μm,含组织面积大于25mm2的切片12张 | 厚度在5-10μm,含组织面积大于25mm2的切片12张 | - | - | - | - | - | - | - |
粪便样本 | - | - | - | - | ≥1g | ≥1g | - | - | - |
菌体 | ≥2×10 6个 | ≥2×10 6个 | ≥2×10 6个 | ≥10 7个 | - | - | ≥10 7个 | ≥5×10 7个 | - |
≥0.2g | ≥0.2g | ≥0.5g | ≥0.5g | ≥0.5g | ≥0.5g | ≥0.5g | ≥0.8g | ||
半固体细菌 | ≥0.5mL | ≥0.5mL | - | - | - | - | - | - | - |
常见问题
1. 二代测序错误率为什么开始和末期会升高?
2. 文库产出均一性指什么
3. 基因组污染对RNA测序的影响?
4. 文库库检出现接头污染/含小片段如何处理?
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