全球分布的共生酵母菌白念珠菌(Candida tropicalis)引发的侵袭性感染与超过50%的死亡率密切相关。特别是在亚太地区,抗唑类药物耐药性显著上升,成为严重的公共卫生问题。研究团队通过多位点序列分型(MLST)对1571株全球C. tropicalis分离株进行了基因群体分析,并对其中629株进行了全基因组测序(WGS),其中包括448株中国临床侵袭性菌株和181株公共数据库中的菌株。
结果显示,MLST第四分支是主要的抗唑类耐药克隆。更深入的WGS分析发现,抗唑耐药率的急剧上升与第四分支下的AZR群体快速扩展密切相关。AZR群体的耐药性显著高,其原因在于串联基因重复事件发生在具有 A395T突变的 ERG11 等位基因突变的染色体上。此外,研究还发现Ty3/gypsy类反转录转座子在该群体中高度富集,提示其基因组具有更高的可塑性。这种基因重复不仅增强了ERG11基因的表达水平,还与高水平的抗唑耐药性(如氟康唑MIC≥256 mg/L)相关。
研究进一步通过体外实验验证,ERG11基因拷贝数的增加确实导致了抗唑耐药性的增强,且这种基因重复在缺乏抗唑压力时依然保持稳定。最终,研究强调了持续监测第四分支AZR群体的重要性,以应对日益严峻的抗真菌耐药性威胁。
值得一提的是,PacBio的长读长测序技术在本研究中发挥了关键作用,发现了ERG11基因的串联重复事件,为理解耐药机制提供了重要支持
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