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单细胞测序

单细胞转录组与基因组组装揭示牦牛适应性进化的遗传和细胞机制

Long read genome assemblies complemented by single cell RNA-sequencing reveal genetic and cellular mechanisms underlying the adaptive evolution of yak[1]

期刊:Nature Communications
影响因子:17.694
发表单位:中国科学院西北高原生物研究所
发表时间:2022年9月

研究思路

研究内容

牦牛作为世界上生活在最高海拔地区的最大型反刍动物之一,演化出了独特的生理机制以适应缺氧和严寒环境。家养牦牛和野牦牛在形态上存在显著差异,但都具备适应高海拔环境的遗传特性,因此被视为研究大型哺乳动物对缺氧耐受性的理想模型,由于参考基因组的局限性,因此对牦牛适应性的分子遗传机制的理解仍有限。
本文作者成功组装了野牦牛和家牦牛的高质量染色体水平基因组,提供了全基因组的SV目录以及牛肺组织的单细胞转录组谱,这些高质量的基因组和转录组数据为未来对牛科动物的研究提供了宝贵的资源,有助于深入解析牦牛适应极端环境的分子机制。

参考文献

[1]Gao X, Wang S, Wang YF, et al. Long read genome assemblies complemented by single cell RNA-sequencing reveal genetic and cellular mechanisms underlying the adaptive evolution of yak. Nat Commun. 2022;13(1):4887. Published 2022 Sep 6. doi:10.1038/s41467-022-32164-9

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